5000元人民币在日本的住宿费用取决于旅游者的旅游计划。如果选择住宿质量较低的青年旅馆或宿舍，每晚可能大约在2000至3000元人民币之间，可以住1-3晚。如果选择住宿质量较高的酒店，每晚可能需要在4000元人民币以上，可以住1-2晚。除住宿费用外，还需要考虑旅行、食品、购物等费用。因此，如果预算仅有5000元人民币，建议选择住宿质量较低的选项且精打细算。另外，预订时应考虑旅游旺季和淡季的不同价格，以及是否有优惠活动。
