办理日本留学签证需要准备以下材料:1.有效护照;2.填写完整的签证申请表;3.学校录取通知书;4.学校出具的在校证明;5.来自银行的存款证明;6.来自学校或导师的推荐信;7.来自学校的日本语能力证明;8.来自大使馆的语言能力证明;9.来自大使馆的健康证明。在准备好以上材料后,需要选择合适的签证类型,如留学预科签证、短期留学签证或普通留学签证。接下来需要在日本驻所在国或地区的大使馆、领事馆或签证中心进行签证申请提交,提交后可以进行跟踪申请进展情况。最后需要等待签证审批结果,在拿到签证后才可以办理机票、住宿等相关事宜。